近日，유로 2024 베팅动物生态学团队联合中国科유로 2024 베팅动物研究所、钱江源国家公园管理局及北京林业大学首次破译锥栗冠绵蚧Coronaproctus castanopsis这一重要林业害虫的基因组，该成果于2月17日以“A chromosome-level genome assembly of the forestry pest Coronaproctus castanopsis”为题发表在Scientific Data期刊（中科院二区，IF=9.8），유로 2024 베팅黄羿鑫副教授为论文第一作者。
锥栗冠绵蚧隶属于半翅目绵蚧科冠绵蚧属，是在钱江源国家公园发现的一新物种，对国家公园内甜槠、米槠林造成严重危害。为探明锥栗冠绵蚧的基因组特征，探究其危害的分子机制，本研究结合二代、三代基因组测序技术及Hi-C辅助技术，首次完成了锥栗冠绵蚧的染色体水平基因组组装。结果显示，锥栗冠绵蚧基因组大小为700.81Mb，scaffold与contig数量分别为53和161，scaffold N50与contig N50长度分别为273.84和12.37 Mb，有98.32%的基因定位在三条染色体上。其中二代survey、二代RNA、三代RNA以及三代Hifi数据回帖率分别达97.84%、96.15%、97.96%和99.33%，基因组组装BUSCO评估完整性为91.2%，以上指标均说明锥栗冠绵蚧基因组组装无论是在连续性、完整性上都达到很高的水准。
目前世界上已知8520余种蚧虫，其中绝大部分为农、林及花卉业害虫，但Genbank数据库中仅保存有13条蚧总科基因组数据，这严重阻碍了对这一类群的深入研究，本研究结果可进一步丰富蚧虫的基因组数据，并为后续锥栗冠绵蚧的深入研究奠定基础。
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图1钱江源国家公园内锥栗冠绵蚧生态照 | 图2锥栗冠绵蚧基因组Hi-C热图 |
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41597-024-03016-6
